219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0731 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 477 aa  951    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  61.03 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  29.94 
 
 		 575 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 553 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 557 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 666 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  28.85 
 
 		 606 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  28.05 
 
 		 605 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  28.3 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.95 
 
 		 601 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  28.24 
 
 		 585 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  29.01 
 
 		 563 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.01 
 
 		 563 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 564 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 558 aa  107  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 554 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.09 
 
 		 568 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 558 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.09 
 
 		 553 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  29.24 
 
 		 553 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.09 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.37 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.37 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.37 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.37 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 586 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 600 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 558 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  27.95 
 
 		 622 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  27.95 
 
 		 622 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 558 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 558 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 558 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  26.74 
 
 		 575 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  27.67 
 
 		 578 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 558 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  27.27 
 
 		 520 aa  96.7  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.92 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  27.58 
 
 		 323 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  25.23 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  27.08 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  26.51 
 
 		 561 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  25.95 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  26.89 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 535 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 		 535 aa  90.9  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  27.34 
 
 		 510 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  26.79 
 
 		 536 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 509 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  27.47 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.83 
 
 		 548 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.61 
 
 		 550 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  26.28 
 
 		 468 aa  87.8  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  26.5 
 
 		 580 aa  87  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  26.92 
 
 		 524 aa  87  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.46 
 
 		 548 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.46 
 
 		 548 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.46 
 
 		 548 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.46 
 
 		 548 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.87 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  24.83 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  27.96 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  26.13 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.14 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.14 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 573 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.14 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.73 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 601 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  28.88 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  25.44 
 
 		 611 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.15 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  25 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.3 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  27.3 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.75 
 
 		 569 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  24.43 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  25.84 
 
 		 612 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  26.97 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  27.19 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  25.97 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.78 
 
 		 553 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  24.92 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  23.94 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  25.99 
 
 		 612 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.75 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.51 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.81 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.6 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>