50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2390 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 685 aa  1300    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  60.8 
 
 		 670 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  53.6 
 
 		 701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  54.12 
 
 		 622 aa  505  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  53.97 
 
 		 622 aa  502  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  53.97 
 
 		 622 aa  502  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  53.82 
 
 		 628 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  47.69 
 
 		 635 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  52.37 
 
 		 628 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  49.44 
 
 		 626 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  43.44 
 
 		 747 aa  452  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  47.86 
 
 		 678 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  48.83 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  57.83 
 
 		 753 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  54.85 
 
 		 746 aa  435  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  48.81 
 
 		 634 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 621 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 621 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 		 621 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  49.8 
 
 		 697 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  49.33 
 
 		 700 aa  412  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  43.06 
 
 		 655 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  37.29 
 
 		 629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  43.88 
 
 		 756 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  42.02 
 
 		 562 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  59.35 
 
 		 843 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  32.76 
 
 		 635 aa  273  8.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 		 694 aa  243  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  34.43 
 
 		 644 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  30.56 
 
 		 687 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  46.4 
 
 		 655 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 718 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  42.32 
 
 		 717 aa  189  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 		 669 aa  184  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 		 784 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  35.31 
 
 		 700 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 719 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  48.21 
 
 		 795 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  38.73 
 
 		 230 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  43.42 
 
 		 276 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 554 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  23.68 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.59 
 
 		 575 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  24.23 
 
 		 600 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 574 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 541 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  26.7 
 
 		 574 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  26.53 
 
 		 502 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 582 aa  44.3  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  26.67 
 
 		 519 aa  44.3  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>