54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1924 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 670 aa  1295    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  56.43 
 
 		 701 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  52.48 
 
 		 622 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  51.19 
 
 		 628 aa  505  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  52.33 
 
 		 622 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  52.33 
 
 		 622 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  66.74 
 
 		 685 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  49.35 
 
 		 678 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  51 
 
 		 628 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  43.82 
 
 		 747 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  48.43 
 
 		 634 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  42.31 
 
 		 635 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  53.69 
 
 		 746 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  55.87 
 
 		 626 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  54.47 
 
 		 753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  48.75 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  47.72 
 
 		 697 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  53.44 
 
 		 641 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  54.62 
 
 		 621 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  54.62 
 
 		 621 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  54.62 
 
 		 621 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  43.7 
 
 		 562 aa  344  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  50 
 
 		 655 aa  337  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  44.79 
 
 		 756 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  35.39 
 
 		 629 aa  326  9e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  60.71 
 
 		 843 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  29.97 
 
 		 635 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 669 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 694 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 718 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  31.56 
 
 		 644 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  41.91 
 
 		 655 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 		 717 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 784 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  40.66 
 
 		 687 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  36.62 
 
 		 700 aa  171  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  45.97 
 
 		 795 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 719 aa  80.5  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  43.18 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  44.74 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  28.13 
 
 		 554 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 541 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  24.78 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  30.3 
 
 		 549 aa  49.7  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  20.9 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  27.88 
 
 		 565 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  24.88 
 
 		 574 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  24.71 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  29.75 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 574 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  30.94 
 
 		 580 aa  45.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  23.7 
 
 		 466 aa  44.3  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>