101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2132 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
719 aa  1372    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  82.4 
 
 
700 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  46.46 
 
 
701 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  61.43 
 
 
753 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  52.95 
 
 
635 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  46.69 
 
 
670 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  48.78 
 
 
697 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  56.2 
 
 
626 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  58.86 
 
 
641 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  57.58 
 
 
621 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  57.58 
 
 
621 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  57.58 
 
 
621 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  54.8 
 
 
628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  40.65 
 
 
634 aa  352  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  55.3 
 
 
622 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  55.3 
 
 
622 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  55.09 
 
 
622 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  47.34 
 
 
655 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  44.12 
 
 
756 aa  336  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  61.02 
 
 
747 aa  331  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  50.58 
 
 
628 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  60.73 
 
 
843 aa  291  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  40.23 
 
 
629 aa  285  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  47.12 
 
 
562 aa  265  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  36.59 
 
 
635 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  45.87 
 
 
655 aa  220  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
694 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  38.28 
 
 
644 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
669 aa  194  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  39.53 
 
 
700 aa  179  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  40.56 
 
 
784 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  37.93 
 
 
687 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
717 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
718 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  61.21 
 
 
746 aa  146  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  64.18 
 
 
795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  45.24 
 
 
685 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  45.05 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  43 
 
 
276 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 
603 aa  60.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
574 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
574 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  26.09 
 
 
565 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  27.32 
 
 
574 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
582 aa  55.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  32.91 
 
 
1146 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  37.39 
 
 
527 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  23.96 
 
 
534 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 
505 aa  51.6  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  26.6 
 
 
323 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  26.16 
 
 
563 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.16 
 
 
563 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.01 
 
 
864 aa  51.6  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.9 
 
 
1163 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0725  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
609 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
585 aa  51.2  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
574 aa  51.2  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  27.6 
 
 
574 aa  50.8  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  32.88 
 
 
580 aa  50.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
574 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
574 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
573 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  29.75 
 
 
519 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  21.43 
 
 
544 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.04 
 
 
601 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  30.58 
 
 
2851 aa  49.7  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  32.52 
 
 
573 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
586 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  23.98 
 
 
580 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  26.56 
 
 
622 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  26.56 
 
 
622 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.38 
 
 
2914 aa  48.1  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  33.06 
 
 
565 aa  48.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  25.28 
 
 
528 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
565 aa  48.1  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.33 
 
 
575 aa  47.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 
477 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  30.41 
 
 
556 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.93 
 
 
575 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  30.08 
 
 
514 aa  47.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  28.12 
 
 
541 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.85 
 
 
1140 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  29.05 
 
 
556 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
554 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
601 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2751  glycosyl transferase family 39  22.33 
 
 
485 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1976  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
541 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.167644  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
483 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  43.18 
 
 
606 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14261  glycosyltransferase  27.33 
 
 
555 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.259667  hitchhiker  0.00324745 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  26.61 
 
 
466 aa  45.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  26.32 
 
 
618 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1913  dolichyl-phosphate-mannose- proteinmannosyltransf erase  35.29 
 
 
653 aa  45.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.954673  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.48 
 
 
505 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  27.94 
 
 
502 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
666 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.19 
 
 
496 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  30.43 
 
 
516 aa  44.3  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
582 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.24 
 
 
502 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>