45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6394 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  100 
 
 
756 aa  1436    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  62.35 
 
 
655 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  44.2 
 
 
701 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  50.57 
 
 
746 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  40.24 
 
 
747 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 
795 aa  355  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  43.59 
 
 
697 aa  339  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  51.31 
 
 
670 aa  333  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  46.19 
 
 
678 aa  329  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  47.55 
 
 
719 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  50.56 
 
 
622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  47.64 
 
 
626 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  50.34 
 
 
622 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  50.34 
 
 
622 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  51.05 
 
 
628 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  40.65 
 
 
634 aa  300  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 
753 aa  296  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
700 aa  295  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  48.87 
 
 
685 aa  293  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  48.03 
 
 
628 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  49.67 
 
 
843 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  51.41 
 
 
641 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  34.05 
 
 
629 aa  260  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  32.2 
 
 
635 aa  259  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  47.65 
 
 
621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  47.65 
 
 
621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  47.65 
 
 
621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
694 aa  237  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  39.96 
 
 
644 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
718 aa  228  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  45.98 
 
 
655 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  35.85 
 
 
562 aa  216  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  42.37 
 
 
669 aa  206  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  43.5 
 
 
687 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  45.02 
 
 
717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
784 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  38.18 
 
 
700 aa  182  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  41.72 
 
 
230 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  54.55 
 
 
276 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  26.89 
 
 
519 aa  48.9  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4199  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
601 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.458284  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  44.09 
 
 
2914 aa  48.5  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
554 aa  45.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  38.46 
 
 
2851 aa  44.7  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  35.82 
 
 
635 aa  43.9  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>