55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5911 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
644 aa  1258    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  36.52 
 
 
701 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  33.01 
 
 
635 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  30.47 
 
 
687 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  39.04 
 
 
756 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  37.47 
 
 
746 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
626 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  36.64 
 
 
747 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
795 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  35.7 
 
 
678 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
622 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
622 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
622 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  36.85 
 
 
719 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
628 aa  184  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
753 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  45.8 
 
 
655 aa  183  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 
628 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  36.28 
 
 
670 aa  177  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  43.64 
 
 
655 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  27.24 
 
 
629 aa  173  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  41.91 
 
 
669 aa  173  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  41.3 
 
 
641 aa  171  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  31.32 
 
 
697 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  27.91 
 
 
700 aa  168  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  36.93 
 
 
634 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  29.59 
 
 
635 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
784 aa  158  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
685 aa  157  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  43.54 
 
 
700 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
717 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
694 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  33.94 
 
 
562 aa  144  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  37.4 
 
 
843 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  54.17 
 
 
230 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  38.85 
 
 
276 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  27.81 
 
 
525 aa  50.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  27.46 
 
 
606 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
603 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 
519 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  26.42 
 
 
622 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  26.42 
 
 
622 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  25.54 
 
 
528 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  26.06 
 
 
515 aa  45.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  35.51 
 
 
565 aa  44.3  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
565 aa  44.3  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
484 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
484 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  31.97 
 
 
527 aa  43.9  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
484 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  26.77 
 
 
484 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>