77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0319 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 795 aa  1536    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  53.16 
 
 		 719 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  70.34 
 
 		 753 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  49.87 
 
 		 747 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  54.05 
 
 		 700 aa  534  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  55.6 
 
 		 635 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  56.3 
 
 		 746 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  45.44 
 
 		 701 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  54.58 
 
 		 626 aa  422  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  48.74 
 
 		 678 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  53.93 
 
 		 641 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  53.63 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  54.29 
 
 		 622 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  54.09 
 
 		 622 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  54.09 
 
 		 622 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  53.6 
 
 		 628 aa  363  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  53.35 
 
 		 621 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  53.35 
 
 		 621 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  53.35 
 
 		 621 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  46.75 
 
 		 655 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  45.22 
 
 		 634 aa  313  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  60 
 
 		 843 aa  313  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  37.3 
 
 		 629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  44.55 
 
 		 562 aa  257  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  33.21 
 
 		 635 aa  238  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 669 aa  230  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  31.15 
 
 		 687 aa  230  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 717 aa  227  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 784 aa  227  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  32.79 
 
 		 700 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  35.57 
 
 		 644 aa  220  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  49.13 
 
 		 756 aa  220  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 		 694 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  50.64 
 
 		 655 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 718 aa  158  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  60.87 
 
 		 697 aa  131  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  51.06 
 
 		 230 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  51.9 
 
 		 685 aa  88.6  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  46.43 
 
 		 670 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  46.84 
 
 		 276 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 554 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  24.87 
 
 		 534 aa  54.3  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 603 aa  53.5  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 582 aa  52.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 586 aa  52.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 564 aa  50.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  26.79 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 585 aa  50.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.82 
 
 		 496 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.53 
 
 		 505 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 509 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  36.31 
 
 		 505 aa  48.5  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1146 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  45.45 
 
 		 606 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 		 600 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.87 
 
 		 563 aa  47.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  27.87 
 
 		 563 aa  47.8  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.98 
 
 		 575 aa  47.8  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  29.13 
 
 		 622 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 574 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  32.29 
 
 		 611 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  29.13 
 
 		 622 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2751  glycosyl transferase family 39  25.71 
 
 		 485 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 574 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  30.3 
 
 		 498 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  25.2 
 
 		 466 aa  46.6  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  35.42 
 
 		 575 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14261  glycosyltransferase  28.89 
 
 		 555 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.259667  hitchhiker  0.00324745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 573 aa  45.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25 
 
 		 864 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 477 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.66 
 
 		 502 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 636 aa  44.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  25.52 
 
 		 574 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 		 553 aa  44.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  31.54 
 
 		 578 aa  44.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  27.34 
 
 		 580 aa  43.9  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>