72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3143 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
634 aa  1220    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  51.08 
 
 
678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  46.39 
 
 
701 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  47.32 
 
 
670 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  45.79 
 
 
622 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  45.79 
 
 
622 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  45.79 
 
 
622 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  41.96 
 
 
635 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  43.85 
 
 
626 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  45.99 
 
 
628 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 
621 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 
621 aa  349  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 
621 aa  349  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  44.47 
 
 
795 aa  333  8e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  43.37 
 
 
697 aa  329  9e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  42.47 
 
 
700 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  44.02 
 
 
628 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  47.33 
 
 
641 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  51.09 
 
 
685 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  46 
 
 
719 aa  317  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  40.75 
 
 
562 aa  316  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  37.34 
 
 
629 aa  310  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  45.91 
 
 
753 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  41.57 
 
 
746 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  38.85 
 
 
756 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  57.14 
 
 
843 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  32.81 
 
 
635 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  43.24 
 
 
655 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  52.92 
 
 
747 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
717 aa  234  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
694 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
669 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
784 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  26.63 
 
 
700 aa  204  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  27.91 
 
 
687 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  32 
 
 
644 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  43.85 
 
 
655 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
718 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  49.44 
 
 
230 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  47.37 
 
 
276 aa  76.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.25 
 
 
534 aa  61.6  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  25.73 
 
 
466 aa  60.8  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  28.77 
 
 
575 aa  58.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
554 aa  57.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  38.03 
 
 
575 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  30.41 
 
 
323 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  24.71 
 
 
512 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
564 aa  52  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  24.63 
 
 
612 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
586 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 
1146 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  26.78 
 
 
565 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
553 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  23.76 
 
 
622 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  23.46 
 
 
605 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  23.76 
 
 
622 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
666 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  23.39 
 
 
563 aa  46.2  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.28 
 
 
496 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  29.53 
 
 
574 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  27.8 
 
 
556 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
574 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
573 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  24.72 
 
 
519 aa  45.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  27.8 
 
 
556 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  27.91 
 
 
1163 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  32.28 
 
 
565 aa  44.3  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
558 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
565 aa  44.3  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  33.61 
 
 
527 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
515 aa  44.3  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
631 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>