77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6499 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
753 aa  1445    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  71.77 
 
 
795 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  58.27 
 
 
719 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  51.47 
 
 
747 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  58.98 
 
 
641 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  58.89 
 
 
700 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  48.61 
 
 
701 aa  495  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  56.82 
 
 
746 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  51.04 
 
 
670 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  54 
 
 
635 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  53.6 
 
 
697 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  53.78 
 
 
843 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  57.94 
 
 
626 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  58.16 
 
 
685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  50.1 
 
 
678 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  56.96 
 
 
621 aa  376  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  56.96 
 
 
621 aa  376  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  56.96 
 
 
621 aa  376  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  47.25 
 
 
622 aa  366  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  47.09 
 
 
622 aa  363  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  47.09 
 
 
622 aa  363  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  52.35 
 
 
628 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  43.46 
 
 
756 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  46.93 
 
 
655 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  34.39 
 
 
629 aa  323  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  33.64 
 
 
635 aa  307  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  36.82 
 
 
562 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
694 aa  226  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  36.56 
 
 
644 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  45.06 
 
 
655 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 
669 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 
784 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  37.45 
 
 
700 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
718 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  38.59 
 
 
687 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
717 aa  164  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  51.38 
 
 
628 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  47.46 
 
 
634 aa  90.1  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2952  hypothetical protein  44.94 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2877  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
574 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  28.93 
 
 
519 aa  53.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
582 aa  53.5  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  38.54 
 
 
575 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
554 aa  51.6  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  33.01 
 
 
622 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  33.01 
 
 
622 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  27.08 
 
 
574 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
585 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  33.72 
 
 
606 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
574 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
586 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
603 aa  48.5  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
600 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  31.87 
 
 
563 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  31.87 
 
 
563 aa  48.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  27.42 
 
 
323 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  24.5 
 
 
534 aa  48.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.43 
 
 
864 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  32.3 
 
 
580 aa  47.8  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
477 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  30.3 
 
 
498 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 
1146 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  28.89 
 
 
600 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  25.38 
 
 
580 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.34 
 
 
496 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4658  family 39 glycosyl transferase  26.09 
 
 
544 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2751  glycosyl transferase family 39  25.81 
 
 
485 aa  45.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  28.12 
 
 
578 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  25.79 
 
 
574 aa  45.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.91 
 
 
505 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4587  glycosyl transferase family 39  38.33 
 
 
584 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000502234  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  28.24 
 
 
528 aa  44.3  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  42.22 
 
 
582 aa  44.3  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
573 aa  44.3  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  26.89 
 
 
563 aa  43.9  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
636 aa  43.9  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>