38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3108 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3108  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  100 
 
 		 562 aa  1097    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4697  glycosyl transferase family 39  40.23 
 
 		 701 aa  343  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3922  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 		 622 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3996  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 		 622 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0580758  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3937  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 		 622 aa  323  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4425  glycosyl transferase family protein  42.43 
 
 		 628 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0143  glycosyl transferase family 39  42.07 
 
 		 678 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1924  glycosyl transferase family 39  41.92 
 
 		 670 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1938  glycosyl transferase family 39  40.47 
 
 		 635 aa  292  9e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4427  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 626 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2269  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 628 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2132  glycosyl transferase family protein  46.87 
 
 		 719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00802467  hitchhiker  0.00453375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0319  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 		 795 aa  274  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3939  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 621 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3924  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 621 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.73215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3998  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 621 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.618428  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2279  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 		 700 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.286519  decreased coverage  0.00538135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0829  glycosyl transferase family 39  42.34 
 
 		 697 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0722108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3143  glycosyl transferase family 39  51.15 
 
 		 634 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2390  glycosyl transferase family protein  49.1 
 
 		 685 aa  253  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267497  normal  0.0227024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6499  glycosyl transferase family protein  44.39 
 
 		 753 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945206  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1722  glycosyl transferase family 39  45.66 
 
 		 641 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5251  glycosyl transferase family 39  39.91 
 
 		 747 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0437  glycosyl transferase family 39  41.89 
 
 		 746 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0438  glycosyl transferase family 39  36.24 
 
 		 655 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6394  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  42.47 
 
 		 756 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0901  glycosyl transferase family 39  55.8 
 
 		 843 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438692  normal  0.261805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2628  glycosyl transferase family 39  32.4 
 
 		 629 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  30.82 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4311  glycosyl transferase family 39  28.36 
 
 		 687 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1332  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 717 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 694 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5911  glycosyl transferase family 39  33.22 
 
 		 644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.871376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0748  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 784 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1597  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 718 aa  113  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0514449  normal  0.160515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0101  glycosyltransferase  31.61 
 
 		 700 aa  90.1  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 554 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>