197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1770 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  100 
 
 
812 aa  1639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  32.16 
 
 
498 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  32.02 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.28 
 
 
274 aa  193  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  29.17 
 
 
465 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  32.72 
 
 
527 aa  129  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.95 
 
 
531 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0294  hypothetical protein  27.12 
 
 
473 aa  125  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.717495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0325  putative glycosyltransferase protein  28.43 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.368248  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1776  hypothetical protein  32.01 
 
 
480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  24.46 
 
 
487 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
636 aa  111  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.39 
 
 
273 aa  108  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.23 
 
 
864 aa  107  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.11 
 
 
278 aa  99.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
496 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.7 
 
 
528 aa  99  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.3 
 
 
261 aa  98.6  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1518  glycosyl transferase family 39  23.83 
 
 
506 aa  97.4  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.5 
 
 
596 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.09 
 
 
528 aa  95.5  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.57 
 
 
272 aa  94.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.67 
 
 
279 aa  94.7  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.18 
 
 
496 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
496 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
497 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  31.88 
 
 
461 aa  92  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  25.9 
 
 
475 aa  91.3  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1220  glycosyltransferase  31.69 
 
 
490 aa  90.1  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  28.09 
 
 
494 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  34.69 
 
 
266 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.63 
 
 
263 aa  90.1  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.45 
 
 
505 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3624  glycosyltransferase  34.91 
 
 
587 aa  83.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  30.58 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  28.25 
 
 
513 aa  82  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
553 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  33.66 
 
 
550 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  33.66 
 
 
550 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3107  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.14 
 
 
518 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  25.81 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.55 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.15 
 
 
502 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4028  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
520 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278954  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  24.03 
 
 
509 aa  76.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  21.84 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  38 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  24.3 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  28.25 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0600  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  26.78 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.12 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  28.57 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  34.55 
 
 
488 aa  72  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
505 aa  72  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3498  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3508  PMT family 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase/ glycosyltransferase  23.77 
 
 
537 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  25 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.64 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.33 
 
 
217 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  25.21 
 
 
526 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3074  glycosyltransferase  26.96 
 
 
513 aa  63.9  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0020891  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.13 
 
 
311 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0356  hypothetical protein  23.04 
 
 
512 aa  62.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2785  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like protein glycosyltransferase of PMT family  26.96 
 
 
502 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1484  undecaprenyl-phosphomannose:protein mannosyltransferase  23.05 
 
 
497 aa  61.6  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.25 
 
 
227 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  34.71 
 
 
199 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0469  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  29.41 
 
 
510 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.07 
 
 
198 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
502 aa  59.3  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0693  hypothetical protein  22.66 
 
 
497 aa  58.9  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.126702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  25 
 
 
489 aa  58.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
476 aa  58.9  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  23.44 
 
 
493 aa  58.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.43 
 
 
199 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.28 
 
 
199 aa  57.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  23.72 
 
 
534 aa  57.8  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1871  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
503 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.81 
 
 
252 aa  55.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  38.68 
 
 
219 aa  55.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  32.8 
 
 
445 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.93 
 
 
241 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  33.63 
 
 
199 aa  54.7  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1107  glycosyl transferase family 39  27.96 
 
 
496 aa  55.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0699757  normal  0.0751827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  32.74 
 
 
199 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 
207 aa  54.3  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  23.72 
 
 
503 aa  53.9  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2095  glycosyltransferase  23.77 
 
 
510 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0410  glycosyltransferase  23.79 
 
 
505 aa  53.9  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.41 
 
 
225 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.81 
 
 
171 aa  53.5  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
157 aa  53.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  35.64 
 
 
359 aa  52.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  35.64 
 
 
359 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.61 
 
 
305 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0956  glycosyl transferase family 39  25.16 
 
 
497 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>