242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3674 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 585 aa  1180    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  53.86 
 
 		 580 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  45.52 
 
 		 574 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 		 574 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  45.52 
 
 		 574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 574 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  45.61 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  43.1 
 
 		 574 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  45.37 
 
 		 574 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  41.64 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  43.34 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 		 582 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  40.21 
 
 		 573 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3582  glycosyl transferase family 39  40.52 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 		 565 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  39.74 
 
 		 565 aa  306  9.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2850  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  47.75 
 
 		 576 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04470  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  38.79 
 
 		 575 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2993  glycosyl transferase family 39  37.92 
 
 		 567 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0364175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5109  glycosyl transferase family protein  46.77 
 
 		 509 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3109  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.78 
 
 		 665 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576177 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  24.96 
 
 		 611 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  30.67 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  25.95 
 
 		 578 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  26.17 
 
 		 585 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  25.89 
 
 		 563 aa  97.8  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.61 
 
 		 553 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.61 
 
 		 568 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.61 
 
 		 576 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.61 
 
 		 576 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.61 
 
 		 576 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.61 
 
 		 576 aa  97.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  26.33 
 
 		 561 aa  97.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  25.47 
 
 		 553 aa  97.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 586 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  28.78 
 
 		 575 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 600 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.35 
 
 		 568 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  26.7 
 
 		 609 aa  94.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  29.38 
 
 		 528 aa  94.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  29.38 
 
 		 535 aa  94  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  29.38 
 
 		 535 aa  94  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 564 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.81 
 
 		 601 aa  90.1  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.42 
 
 		 555 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  28.45 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  24.53 
 
 		 524 aa  88.6  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 554 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  27.67 
 
 		 323 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  26.21 
 
 		 540 aa  88.2  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 534 aa  87.8  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.44 
 
 		 541 aa  87.4  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1843  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 730 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  28.17 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  24.13 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  26.63 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.12 
 
 		 550 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  27.89 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.89 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.34 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.65 
 
 		 552 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  27.6 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  27.47 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  27.44 
 
 		 556 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  25.74 
 
 		 466 aa  83.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  25.93 
 
 		 510 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2420  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.91 
 
 		 695 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0370858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4820  glycosyl transferase family 39  30.88 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  29.63 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  28.23 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.03 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 553 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  23.89 
 
 		 605 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.14 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 584 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  27.22 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  25.58 
 
 		 612 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25.59 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25.59 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  28.28 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  27.08 
 
 		 601 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 554 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 554 aa  77  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 557 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  27.3 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 613 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  24.3 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>