41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0364 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  100 
 
 		 494 aa  1003    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  30.42 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  32.31 
 
 		 369 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  34.25 
 
 		 236 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5503  hypothetical protein  30.22 
 
 		 264 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  29.11 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2869  hypothetical protein  28.85 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  26.87 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  25.69 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  26.02 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  31.45 
 
 		 873 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  30.82 
 
 		 873 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  26.11 
 
 		 1050 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  27.51 
 
 		 221 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  27.51 
 
 		 1059 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  27.51 
 
 		 1059 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  28.93 
 
 		 872 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  29.17 
 
 		 1020 aa  50.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3694  hypothetical protein  30.34 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  22.32 
 
 		 808 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40647  predicted protein  23.26 
 
 		 366 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  26.55 
 
 		 936 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  29.5 
 
 		 824 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2015  hypothetical protein  22.78 
 
 		 222 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  28.8 
 
 		 868 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3388  hypothetical protein  31.63 
 
 		 245 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  25.25 
 
 		 799 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  29.31 
 
 		 244 aa  47  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  29.15 
 
 		 1018 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  24.75 
 
 		 735 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  27.57 
 
 		 1275 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  28.74 
 
 		 1780 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.6 
 
 		 1141 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  28.67 
 
 		 793 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  25.57 
 
 		 881 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  25.76 
 
 		 799 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  28.18 
 
 		 892 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  28.35 
 
 		 729 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  25.25 
 
 		 1418 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  25.32 
 
 		 788 aa  43.9  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  26.51 
 
 		 1019 aa  43.5  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>