75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13260 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  100 
 
 
538 aa  1066    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  47.14 
 
 
592 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  47.74 
 
 
567 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 
586 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  50 
 
 
585 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  47.06 
 
 
539 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  48.06 
 
 
584 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  46.04 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  43.7 
 
 
541 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  48.92 
 
 
563 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  41.77 
 
 
572 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  44.51 
 
 
537 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  39.22 
 
 
573 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  36.18 
 
 
553 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  40.82 
 
 
508 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  39.11 
 
 
547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
534 aa  312  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
569 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
493 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
493 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
493 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.9 
 
 
520 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  38.91 
 
 
531 aa  299  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  38.32 
 
 
523 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  38.59 
 
 
544 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 
579 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 
528 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  34.82 
 
 
638 aa  294  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
539 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  38.7 
 
 
511 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
525 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
560 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  38.03 
 
 
522 aa  266  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  35.33 
 
 
559 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  35.31 
 
 
534 aa  243  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  35.64 
 
 
507 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  35.05 
 
 
528 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  24.21 
 
 
658 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  26.65 
 
 
441 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  23.11 
 
 
469 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 
493 aa  97.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  22.97 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  22.84 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
487 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  24.9 
 
 
462 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
968 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  23.61 
 
 
566 aa  82.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  21.89 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  24.51 
 
 
444 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0678  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
418 aa  60.1  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
387 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
384 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  28.73 
 
 
740 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
372 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70572  Phospho Mannno Transferase; dolichyl-P-mannose-protein mannosyltransferase  24.44 
 
 
759 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0562818  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
509 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  37.04 
 
 
575 aa  47.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  21.28 
 
 
767 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  20.49 
 
 
745 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  31.12 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.06 
 
 
780 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  31.12 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  30.7 
 
 
635 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  26.88 
 
 
522 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
439 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  26.88 
 
 
522 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
585 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01930  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  24.37 
 
 
807 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  25.71 
 
 
918 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 
918 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1914  glycosyl transferase family 39  23.78 
 
 
450 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.245587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>