62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3241 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
534 aa  1071    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  57.65 
 
 
528 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  53.01 
 
 
516 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  53.65 
 
 
525 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  53.24 
 
 
493 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  53.05 
 
 
493 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  53.05 
 
 
493 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  51.9 
 
 
511 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  53.86 
 
 
522 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  49.52 
 
 
523 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  46.89 
 
 
559 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  35.55 
 
 
539 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
528 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  36.16 
 
 
547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  34 
 
 
553 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  38.25 
 
 
507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
534 aa  269  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  35.04 
 
 
508 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
567 aa  266  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
586 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  35.23 
 
 
573 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  35.25 
 
 
531 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
569 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  37.1 
 
 
520 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  35.21 
 
 
592 aa  253  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  37.25 
 
 
584 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  34.46 
 
 
544 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.31 
 
 
538 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  35.21 
 
 
555 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
539 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.39 
 
 
585 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  32.75 
 
 
572 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
579 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
541 aa  230  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
560 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  34.89 
 
 
563 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  32.58 
 
 
541 aa  226  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  32.76 
 
 
537 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  32.28 
 
 
638 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
487 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  20.08 
 
 
658 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  25.26 
 
 
441 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  22.94 
 
 
492 aa  97.8  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  24.85 
 
 
469 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  23.61 
 
 
469 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.88 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  22.07 
 
 
493 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  24.55 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  24.08 
 
 
566 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  20.34 
 
 
968 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  23.01 
 
 
466 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  22.49 
 
 
745 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  25.42 
 
 
918 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 
918 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
569 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  24.9 
 
 
740 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  35.78 
 
 
546 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.06 
 
 
575 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
384 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>