67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3095 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 968 aa  1982    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  45.35 
 
 		 658 aa  426  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  29.31 
 
 		 566 aa  172  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  29.2 
 
 		 441 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2148  carbohydrate-binding, CenC-like protein  39.25 
 
 		 254 aa  155  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.912332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3096  hypothetical protein  36.32 
 
 		 311 aa  127  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000131499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  25.37 
 
 		 547 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 487 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.17 
 
 		 447 aa  105  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 		 493 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  23.16 
 
 		 553 aa  98.2  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  23.38 
 
 		 531 aa  97.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  24.4 
 
 		 492 aa  95.5  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  21.26 
 
 		 541 aa  95.5  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  23.53 
 
 		 544 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 		 567 aa  90.1  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  21.97 
 
 		 508 aa  89  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  24.59 
 
 		 469 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  24.56 
 
 		 520 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  24.19 
 
 		 538 aa  88.2  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  22.25 
 
 		 493 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 493 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 493 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  21.86 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  24.12 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  25.47 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  21.54 
 
 		 586 aa  85.1  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  22.65 
 
 		 584 aa  84.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 		 525 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0881  carbohydrate-binding, CenC-like protein  28.7 
 
 		 433 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000527436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  23.45 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  21.86 
 
 		 579 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  22 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  21.91 
 
 		 539 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  26.46 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  20.98 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  21.74 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  23.51 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  21 
 
 		 541 aa  74.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  20.52 
 
 		 573 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  22.29 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  23.71 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  22.28 
 
 		 528 aa  67.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  22.71 
 
 		 511 aa  67.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  23.46 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  20.34 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  21.94 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  22.46 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  26.81 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  20.59 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  19.13 
 
 		 572 aa  57  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 414 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  21.89 
 
 		 569 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  23.48 
 
 		 585 aa  55.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  22.51 
 
 		 745 aa  53.9  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 		 512 aa  51.2  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 387 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  20.99 
 
 		 740 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  23.3 
 
 		 767 aa  48.5  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01459  mannosyltransferase PMTI (AFU_orthologue; AFUA_8G04500)  30.99 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.97174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  34.15 
 
 		 490 aa  47  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 		 372 aa  45.8  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 384 aa  45.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1040  glycosyl transferase family protein  20.88 
 
 		 448 aa  44.7  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000509262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>