66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1486 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
528 aa  1057    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  58.89 
 
 
525 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  58.55 
 
 
493 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  56.06 
 
 
516 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  58.55 
 
 
493 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  58.55 
 
 
493 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  60.16 
 
 
522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  57.65 
 
 
534 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  56.11 
 
 
523 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  56.02 
 
 
511 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  50.48 
 
 
559 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
528 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
534 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  37.45 
 
 
539 aa  294  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  39.75 
 
 
507 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  34.29 
 
 
547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 
567 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 
569 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
586 aa  279  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  32.16 
 
 
553 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  36.89 
 
 
584 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
539 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  35.42 
 
 
531 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  34.38 
 
 
508 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  33.07 
 
 
573 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.05 
 
 
538 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  32.4 
 
 
520 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
541 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  33.27 
 
 
544 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
579 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  32.85 
 
 
541 aa  239  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
560 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  33.91 
 
 
592 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  34.13 
 
 
585 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  36.14 
 
 
555 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  36.67 
 
 
537 aa  224  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  33.14 
 
 
572 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  35.21 
 
 
563 aa  213  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  34.71 
 
 
638 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  26.95 
 
 
441 aa  133  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
487 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  22.85 
 
 
492 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.71 
 
 
447 aa  96.7  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  22.52 
 
 
469 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  22.27 
 
 
462 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  22.76 
 
 
469 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  20.22 
 
 
493 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  20.78 
 
 
658 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  25.89 
 
 
444 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  22.28 
 
 
968 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  22.12 
 
 
566 aa  73.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  20.68 
 
 
466 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
414 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  31.65 
 
 
575 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
543 aa  47.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  29.71 
 
 
553 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  22.66 
 
 
767 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  22.02 
 
 
918 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
372 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 
323 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.62 
 
 
569 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
384 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  30.28 
 
 
536 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
541 aa  43.5  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>