59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3663 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
539 aa  1069    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  72.07 
 
 
534 aa  753    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  71.83 
 
 
569 aa  742    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
528 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  41.95 
 
 
553 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  42.2 
 
 
547 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  41.22 
 
 
520 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  40.32 
 
 
539 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 
586 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
567 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  40.19 
 
 
573 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  41.81 
 
 
531 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  40.21 
 
 
584 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  41.46 
 
 
508 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  41.93 
 
 
579 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  39.89 
 
 
544 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  38.36 
 
 
638 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
560 aa  339  9e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  38.01 
 
 
541 aa  332  8e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.11 
 
 
541 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.92 
 
 
538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  38.39 
 
 
511 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  38.65 
 
 
592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  36.47 
 
 
523 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  37.52 
 
 
559 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  38.48 
 
 
537 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
493 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.43 
 
 
585 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
516 aa  278  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  35.86 
 
 
528 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  35.31 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  35.94 
 
 
522 aa  269  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
525 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  38.24 
 
 
507 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  37.38 
 
 
563 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  33.52 
 
 
555 aa  250  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  35.33 
 
 
534 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  23.03 
 
 
658 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.99 
 
 
447 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  27.05 
 
 
441 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 
968 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 
487 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  20.58 
 
 
492 aa  89.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  24.17 
 
 
462 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  22.53 
 
 
466 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  22.17 
 
 
469 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  22.22 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  26.32 
 
 
767 aa  76.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  25.17 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  21.53 
 
 
566 aa  67  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
918 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
541 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  21.99 
 
 
745 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72313  predicted protein  27.52 
 
 
758 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502969  normal  0.112596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 
372 aa  44.3  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>