53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0385 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  100 
 
 
638 aa  1271    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  57.05 
 
 
544 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  40.07 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
586 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  37.68 
 
 
539 aa  389  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  40.74 
 
 
547 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.86 
 
 
520 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  40.24 
 
 
569 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
528 aa  351  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.91 
 
 
541 aa  340  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  41.46 
 
 
537 aa  340  5.9999999999999996e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
534 aa  333  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
539 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  37.48 
 
 
541 aa  323  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  35.74 
 
 
572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  34.73 
 
 
523 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  34.16 
 
 
538 aa  300  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  35.38 
 
 
508 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  35.63 
 
 
555 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  47.3 
 
 
567 aa  283  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  33.71 
 
 
559 aa  277  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
493 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  34.55 
 
 
511 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  47.06 
 
 
531 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  46.67 
 
 
584 aa  273  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 
516 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  33.04 
 
 
522 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
525 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  45.77 
 
 
592 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 
560 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  43.79 
 
 
579 aa  224  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  42.41 
 
 
585 aa  219  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  30.33 
 
 
534 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  39.01 
 
 
573 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  29.1 
 
 
528 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  36.94 
 
 
507 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  34.19 
 
 
563 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  31.79 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  22.53 
 
 
658 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  28.02 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
493 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
968 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  31.82 
 
 
462 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 
487 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  22.84 
 
 
767 aa  57.4  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  23.13 
 
 
469 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  23.7 
 
 
469 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.68 
 
 
447 aa  54.7  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  28.22 
 
 
466 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  26.16 
 
 
492 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  20.35 
 
 
745 aa  48.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>