61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  100 
 
 		 585 aa  1157    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  54.45 
 
 		 572 aa  569  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  52.43 
 
 		 555 aa  529  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  49.83 
 
 		 592 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  50 
 
 		 538 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  44.17 
 
 		 586 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  43.31 
 
 		 567 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  46.01 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  43.1 
 
 		 584 aa  432  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  44.1 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  45.41 
 
 		 563 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  45.78 
 
 		 537 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.11 
 
 		 553 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  40.67 
 
 		 528 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  40.84 
 
 		 531 aa  349  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  40.37 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  38.8 
 
 		 573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  39.38 
 
 		 547 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  40.41 
 
 		 520 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  35.41 
 
 		 638 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  38.15 
 
 		 534 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 		 569 aa  312  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  38.37 
 
 		 523 aa  309  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  38.19 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  37.43 
 
 		 516 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 579 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 		 541 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 		 560 aa  293  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  36.51 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  37.72 
 
 		 522 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  37.52 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 		 539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  36.14 
 
 		 559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  35.53 
 
 		 534 aa  266  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  37.13 
 
 		 507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  34.91 
 
 		 528 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  25.05 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  21.59 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.3 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  21.54 
 
 		 487 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  25.5 
 
 		 462 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  21.89 
 
 		 466 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  21.04 
 
 		 469 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  20 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  19.79 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  20.86 
 
 		 469 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  21.03 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  24.3 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  20.6 
 
 		 968 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 		 918 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  19.93 
 
 		 745 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  23.73 
 
 		 918 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0678  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 439 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 384 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 509 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  21.03 
 
 		 767 aa  44.3  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 		 372 aa  44.3  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>