60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1964 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
572 aa  1121    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  57.43 
 
 
585 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 
586 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  44.33 
 
 
592 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  42.66 
 
 
567 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  46.11 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  44.64 
 
 
555 aa  399  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  43.86 
 
 
539 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  41.77 
 
 
538 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  41.76 
 
 
541 aa  362  7.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  42.58 
 
 
537 aa  350  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  42.12 
 
 
563 aa  340  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.1 
 
 
553 aa  333  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  38.56 
 
 
547 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  42.46 
 
 
520 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  38.71 
 
 
544 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  36.19 
 
 
531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  38.13 
 
 
528 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
534 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  35.58 
 
 
523 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  36.28 
 
 
573 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
516 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
493 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
493 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
569 aa  259  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
493 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  35.76 
 
 
522 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  34.44 
 
 
511 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
579 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
525 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  35.76 
 
 
508 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
539 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
560 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
541 aa  236  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  33.27 
 
 
559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  38.66 
 
 
507 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  34.23 
 
 
534 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  33.4 
 
 
528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  38.85 
 
 
638 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  24.51 
 
 
441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  21.66 
 
 
487 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  22.74 
 
 
462 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  20.33 
 
 
658 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  19.96 
 
 
492 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.01 
 
 
447 aa  92  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  19.2 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  21.37 
 
 
566 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  20.99 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  20.56 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  20.75 
 
 
469 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  23.89 
 
 
444 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 
439 aa  59.3  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  19.13 
 
 
968 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 
918 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  25.52 
 
 
918 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  20.93 
 
 
745 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0678  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
418 aa  45.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
387 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  24.11 
 
 
767 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1992  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
387 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.553318  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>