68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3667 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
539 aa  1058    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  50.52 
 
 
567 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  52.68 
 
 
586 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  53.56 
 
 
584 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  51.15 
 
 
541 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  50.18 
 
 
592 aa  465  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  47.06 
 
 
538 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  44.83 
 
 
573 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  45.29 
 
 
585 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  42.91 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  45.8 
 
 
537 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 
528 aa  392  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  43.8 
 
 
572 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  44.79 
 
 
531 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  42.75 
 
 
547 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  42.01 
 
 
520 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  44.06 
 
 
555 aa  382  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
534 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  42.59 
 
 
544 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  43.15 
 
 
541 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  37.03 
 
 
638 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  48.28 
 
 
563 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
569 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  40.69 
 
 
523 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  42.78 
 
 
579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  42.65 
 
 
560 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  39.96 
 
 
539 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  40.75 
 
 
508 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  40.83 
 
 
511 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 
493 aa  336  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  38.85 
 
 
493 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  38.85 
 
 
493 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
525 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  38.15 
 
 
516 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  39.85 
 
 
522 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  38.52 
 
 
559 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  41.19 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  35.55 
 
 
534 aa  283  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  38.09 
 
 
528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  27.32 
 
 
441 aa  127  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  21.01 
 
 
658 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  23.54 
 
 
469 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  24.56 
 
 
462 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  23.28 
 
 
469 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  21.47 
 
 
493 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  22.53 
 
 
466 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
487 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.54 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  21.27 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  21.5 
 
 
566 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  21.91 
 
 
968 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  24.41 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  22.98 
 
 
767 aa  62  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
439 aa  61.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  23.11 
 
 
745 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  23.58 
 
 
918 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01459  mannosyltransferase PMTI (AFU_orthologue; AFUA_8G04500)  24.73 
 
 
773 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.97174 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  22.28 
 
 
918 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  23.49 
 
 
740 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57202  predicted protein  24.6 
 
 
739 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0669356  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0678  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
384 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72313  predicted protein  22.43 
 
 
758 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502969  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  21.2 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0367  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
526 aa  44.3  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  26.97 
 
 
540 aa  43.9  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  26.87 
 
 
540 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>