61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3969 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  72.93 
 
 		 534 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 569 aa  1120    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  68.78 
 
 		 539 aa  717    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  43.92 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  40.77 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  40.6 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  42.56 
 
 		 547 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  41.49 
 
 		 586 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  39.69 
 
 		 539 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  39.96 
 
 		 567 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  41.65 
 
 		 584 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  40.24 
 
 		 638 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  39.12 
 
 		 520 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  39.48 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  40.51 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 		 579 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  39.2 
 
 		 544 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  41.93 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  38.35 
 
 		 592 aa  329  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.36 
 
 		 541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 541 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.83 
 
 		 538 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  37.68 
 
 		 523 aa  311  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.45 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  38.82 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  36.88 
 
 		 493 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  35.38 
 
 		 559 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.74 
 
 		 585 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  36.11 
 
 		 528 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  36.27 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 525 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  33.09 
 
 		 555 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  34.69 
 
 		 522 aa  260  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  34.91 
 
 		 534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  37.36 
 
 		 507 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  36.64 
 
 		 563 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  24.08 
 
 		 658 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  27.02 
 
 		 441 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.42 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  27.7 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  23.11 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  31.76 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  24.14 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  23.42 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  22.68 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  25 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  21.89 
 
 		 968 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72313  predicted protein  28.86 
 
 		 758 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502969  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57202  predicted protein  23.67 
 
 		 739 aa  47.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0669356  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 		 918 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0697  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.203692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 553 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 439 aa  44.3  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  24.18 
 
 		 918 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01459  mannosyltransferase PMTI (AFU_orthologue; AFUA_8G04500)  25.14 
 
 		 773 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.97174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>