66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8625 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  64.16 
 
 
547 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  100 
 
 
520 aa  1034    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  82.95 
 
 
553 aa  860    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  48.96 
 
 
531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  43.69 
 
 
544 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  40.75 
 
 
528 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 
534 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  42.01 
 
 
539 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  42.16 
 
 
573 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
567 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  39.85 
 
 
586 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  40.42 
 
 
541 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  41.31 
 
 
584 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 
569 aa  363  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 
539 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  40.73 
 
 
579 aa  340  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  41.46 
 
 
560 aa  340  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  40.78 
 
 
592 aa  339  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  40.84 
 
 
508 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
541 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  37.14 
 
 
511 aa  329  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  38.85 
 
 
523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  39.89 
 
 
572 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  38.9 
 
 
538 aa  325  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
493 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
493 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
493 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.63 
 
 
585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  39.66 
 
 
537 aa  307  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  40.34 
 
 
563 aa  306  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  36.33 
 
 
559 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 
525 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  34.26 
 
 
555 aa  292  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  36.35 
 
 
522 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  38.48 
 
 
507 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  37.1 
 
 
534 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  43.48 
 
 
638 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  32.34 
 
 
528 aa  238  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  21.4 
 
 
658 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  25.7 
 
 
441 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.98 
 
 
447 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
487 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  26.69 
 
 
462 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
968 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
493 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  21.23 
 
 
492 aa  97.1  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  23.47 
 
 
469 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  22.91 
 
 
469 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  24.18 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  21.85 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  24.86 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
439 aa  62  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  27.04 
 
 
745 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  32.35 
 
 
582 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
553 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
387 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0678  glycosyl transferase family protein  22 
 
 
418 aa  47.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0362  glycosyl transferase family 39  29.11 
 
 
475 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
372 aa  44.3  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
509 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  38.67 
 
 
549 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 
918 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2629  glycosyl transferase family 39  24.75 
 
 
635 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.996302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>