84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3175 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  64.62 
 
 
553 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  100 
 
 
547 aa  1097    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  64.16 
 
 
520 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  52.84 
 
 
531 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  44.13 
 
 
573 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 
534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
528 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  44.07 
 
 
544 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
586 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  42.75 
 
 
539 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
567 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  42.36 
 
 
569 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  43.41 
 
 
584 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  41.65 
 
 
539 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  41.5 
 
 
508 aa  353  7e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 
579 aa  350  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  41.25 
 
 
592 aa  349  9e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  40.67 
 
 
541 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.81 
 
 
541 aa  345  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 
560 aa  345  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.96 
 
 
511 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  38.71 
 
 
523 aa  339  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  38.85 
 
 
572 aa  335  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.11 
 
 
538 aa  326  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  38.73 
 
 
516 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
493 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
493 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  39.77 
 
 
522 aa  320  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 
525 aa  319  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  38.26 
 
 
559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  39.18 
 
 
585 aa  306  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  38.1 
 
 
555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  40.3 
 
 
537 aa  301  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  41.39 
 
 
563 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  36.9 
 
 
534 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  38.55 
 
 
507 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  35.21 
 
 
528 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  45.4 
 
 
638 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  27.33 
 
 
441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  23.64 
 
 
658 aa  133  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.74 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
493 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
968 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
487 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  25.09 
 
 
462 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  22.33 
 
 
566 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  22.26 
 
 
492 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  22.8 
 
 
469 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  22.96 
 
 
469 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  22 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
439 aa  77  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  26.2 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.57 
 
 
549 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  28.83 
 
 
540 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70572  Phospho Mannno Transferase; dolichyl-P-mannose-protein mannosyltransferase  24.15 
 
 
759 aa  55.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0562818  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.06 
 
 
553 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  27.68 
 
 
540 aa  53.9  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
384 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  23.92 
 
 
918 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  21.25 
 
 
767 aa  50.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
554 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
372 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  21.17 
 
 
745 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.94 
 
 
569 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0678  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0502  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  30.08 
 
 
532 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  28.7 
 
 
323 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
387 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  31.46 
 
 
512 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  28.19 
 
 
549 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0362  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 
475 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57202  predicted protein  23.2 
 
 
739 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0669356  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  29.08 
 
 
575 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  38.89 
 
 
549 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  38.89 
 
 
549 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  28.66 
 
 
582 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.41 
 
 
550 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 
918 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
553 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90238  predicted protein  25 
 
 
821 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  20.37 
 
 
740 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
582 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>