207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3865 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  90.06 
 
 		 540 aa  962    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  100 
 
 		 540 aa  1081    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  38.62 
 
 		 532 aa  287  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  30.06 
 
 		 537 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  29.48 
 
 		 575 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.13 
 
 		 550 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.37 
 
 		 554 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.37 
 
 		 554 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.37 
 
 		 554 aa  97.8  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 		 553 aa  96.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.69 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  30.12 
 
 		 580 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.69 
 
 		 552 aa  94  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  27.43 
 
 		 553 aa  94  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  27.89 
 
 		 528 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.07 
 
 		 556 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 554 aa  90.5  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2850  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078924 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.08 
 
 		 550 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.44 
 
 		 550 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.24 
 
 		 555 aa  87.4  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.75 
 
 		 548 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 574 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 574 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  29.9 
 
 		 323 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.36 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  27.36 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  27.36 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  25.78 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.36 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.36 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.36 
 
 		 550 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.36 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.94 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  26.76 
 
 		 600 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  29.62 
 
 		 573 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.12 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.09 
 
 		 569 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  31.07 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  27.12 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.54 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  25.92 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.57 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  25.85 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 		 564 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 574 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  23.54 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  24.78 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  27.48 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1843  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 730 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  23.95 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  27.31 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  25.29 
 
 		 540 aa  76.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  25.27 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  27.08 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.67 
 
 		 583 aa  74.7  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.66 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.58 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  21.51 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  22.37 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13408  putative glycosyltransferase  26.09 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  27.47 
 
 		 599 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2420  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.01 
 
 		 695 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  27.16 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  25.64 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2993  glycosyl transferase family 39  28.9 
 
 		 567 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0364175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.95 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  28.92 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.95 
 
 		 549 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  27.91 
 
 		 527 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  27.66 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  23.05 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  23.05 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  25.92 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  27.47 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3121  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  24.73 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  22.84 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>