184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5588 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  100 
 
 		 576 aa  1153    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5109  glycosyl transferase family protein  85.85 
 
 		 509 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2850  glycosyl transferase family protein  71.75 
 
 		 508 aa  718    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  47.21 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  45.91 
 
 		 580 aa  291  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  50.29 
 
 		 573 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  44.54 
 
 		 574 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  35.79 
 
 		 574 aa  266  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  44.54 
 
 		 574 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  44.25 
 
 		 574 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  46.29 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 		 565 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  44.81 
 
 		 565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3582  glycosyl transferase family 39  47.59 
 
 		 573 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  43.79 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  37.61 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04470  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  43.73 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2993  glycosyl transferase family 39  38.28 
 
 		 567 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0364175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.35 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  30.72 
 
 		 575 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.13 
 
 		 555 aa  97.8  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.9 
 
 		 550 aa  94.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  21.99 
 
 		 524 aa  93.6  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  28.92 
 
 		 540 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.91 
 
 		 550 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.04 
 
 		 550 aa  87.8  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.88 
 
 		 550 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.99 
 
 		 556 aa  87.4  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  26.11 
 
 		 553 aa  87  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.73 
 
 		 550 aa  87  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  27.73 
 
 		 550 aa  87  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.73 
 
 		 550 aa  87  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  27.73 
 
 		 550 aa  87  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.73 
 
 		 550 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.73 
 
 		 550 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.06 
 
 		 601 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.79 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.79 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.79 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.59 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  28.31 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 557 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 600 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.74 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  27.17 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.09 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  26.28 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.74 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.48 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.48 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.48 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.48 
 
 		 576 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.48 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  30.3 
 
 		 556 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.3 
 
 		 556 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  28.14 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  29.89 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  28.1 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 558 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  29.34 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  25.5 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 586 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3109  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.33 
 
 		 665 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  25.8 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  25.21 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  27.35 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  27.35 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  27.83 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  27.32 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  26.12 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  23.5 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  25.62 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  27.56 
 
 		 578 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  26.77 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1857  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.894443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1881  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300143  hitchhiker  0.00000511252 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  27.95 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.68 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  25.36 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  24.31 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>