172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13408 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13408  putative glycosyltransferase  100 
 
 
526 aa  1056    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3438  glycosyl transferase family 39  42.28 
 
 
562 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3502  glycosyl transferase family 39  41.98 
 
 
562 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3356  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
557 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  38.22 
 
 
528 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  25.82 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  24.2 
 
 
563 aa  77  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  25.99 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
582 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 
564 aa  74.3  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  32.05 
 
 
514 aa  74.3  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  26.63 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3950  glycosyl transferase family 39  23.98 
 
 
540 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  25.14 
 
 
606 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  31.22 
 
 
512 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  27.4 
 
 
612 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  26.27 
 
 
612 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  25.41 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  32.28 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
547 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  27.36 
 
 
527 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  24.83 
 
 
515 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
514 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  25.25 
 
 
510 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  33.33 
 
 
519 aa  69.3  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  25.93 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  25.41 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  27.03 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
603 aa  67  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.77 
 
 
554 aa  67  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.77 
 
 
554 aa  67  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.77 
 
 
554 aa  67  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.54 
 
 
575 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.57 
 
 
583 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
553 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
554 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  32.2 
 
 
549 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
522 aa  64.7  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
585 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
564 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3865  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 
540 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  26.26 
 
 
525 aa  63.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  26.79 
 
 
601 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  24.4 
 
 
601 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.54 
 
 
555 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.59 
 
 
601 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.69 
 
 
546 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  22.89 
 
 
537 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  24.51 
 
 
536 aa  61.6  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
477 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  28.08 
 
 
520 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 
530 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 
530 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3121  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
539 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  26.32 
 
 
609 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
631 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  26.46 
 
 
574 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
574 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  26.09 
 
 
604 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
574 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
493 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.32 
 
 
553 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  25.45 
 
 
578 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  28.7 
 
 
575 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
553 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  22.31 
 
 
556 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
534 aa  57.8  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  25.3 
 
 
585 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.67 
 
 
576 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.67 
 
 
576 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.67 
 
 
576 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.88 
 
 
568 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.67 
 
 
576 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  25.64 
 
 
574 aa  57  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.03 
 
 
550 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  25.78 
 
 
541 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
574 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
574 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.01 
 
 
568 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.03 
 
 
550 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2358  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
669 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0564  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  28.46 
 
 
671 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.03 
 
 
550 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
574 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
479 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 
558 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  23.08 
 
 
596 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1311  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  25.4 
 
 
515 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0736647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
558 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.03 
 
 
550 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.03 
 
 
550 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  23.03 
 
 
550 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.69 
 
 
479 aa  53.9  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  23.03 
 
 
550 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.03 
 
 
550 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
558 aa  53.5  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 
534 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.86 
 
 
549 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>