83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0564 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0564  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  100 
 
 		 671 aa  1362    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3960  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  29.52 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0521  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 576 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.309275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6418  glycosyl transferase family 39  27.19 
 
 		 537 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0742779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  26.27 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.56 
 
 		 478 aa  63.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  22.98 
 
 		 530 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  22.98 
 
 		 530 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.56 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3773  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase (lipid A modification)  23.5 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1843  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0771  glycosyltransferase  25.63 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  29.9 
 
 		 561 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  21.91 
 
 		 553 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  27.38 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  27.25 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  38.82 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  26.05 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  24.54 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  27.31 
 
 		 575 aa  57  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1084  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.321902  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  24.24 
 
 		 612 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 574 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4820  glycosyl transferase family 39  34.23 
 
 		 528 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  28.48 
 
 		 565 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2420  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.15 
 
 		 695 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0370858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  27.45 
 
 		 559 aa  54.7  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 509 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  28.41 
 
 		 464 aa  54.3  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 666 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 564 aa  53.9  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.94 
 
 		 541 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  22.89 
 
 		 612 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  25.31 
 
 		 528 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 564 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  22.68 
 
 		 527 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4250  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 463 aa  51.2  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00142595  unclonable  0.0000000186135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  27.07 
 
 		 600 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  23.5 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  24.32 
 
 		 574 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0648  family 39 glycosyl transferase  23.53 
 
 		 515 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 		 584 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  25 
 
 		 563 aa  50.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  31.25 
 
 		 576 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0231  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.57 
 
 		 463 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0407  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 		 463 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0124789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 536 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 574 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.21 
 
 		 555 aa  47.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5537  hypothetical protein  33.61 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 574 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 574 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  26.34 
 
 		 535 aa  47.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  26.34 
 
 		 535 aa  47.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  25.11 
 
 		 534 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 585 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 541 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5109  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  25 
 
 		 519 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 580 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  22.84 
 
 		 514 aa  45.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.99 
 
 		 613 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 		 631 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3121  glycosyl transferase family 39  25.5 
 
 		 577 aa  44.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.64 
 
 		 549 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  32.56 
 
 		 601 aa  44.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 		 550 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  29.84 
 
 		 613 aa  44.3  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63700  hypothetical protein  34.74 
 
 		 478 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  20.87 
 
 		 557 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 600 aa  44.3  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  43.64 
 
 		 573 aa  43.9  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3109  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.75 
 
 		 665 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>