174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1533 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
584 aa  1152    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  73.84 
 
 
580 aa  852    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  75.39 
 
 
581 aa  845    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  73.84 
 
 
580 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  91.03 
 
 
580 aa  1014    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  74.01 
 
 
581 aa  818    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3917  glycosyl transferase family protein 39  77.93 
 
 
580 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4551  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 
577 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4686  glycosyl transferase family 39  45.58 
 
 
598 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 
600 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4542  glycosyl transferase family 39  44.04 
 
 
602 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0207348  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5864  glycosyl transferase family protein  47.88 
 
 
579 aa  353  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0380825  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2164  glycosyl transferase family protein  44.54 
 
 
573 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13008  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4173  glycosyl transferase family protein  52.79 
 
 
602 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  36.82 
 
 
552 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0012  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
557 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
570 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
568 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1482  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 
547 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 
637 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  27.81 
 
 
528 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  31.23 
 
 
553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
547 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  32.02 
 
 
527 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
553 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  29.48 
 
 
605 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  24.49 
 
 
612 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  25.19 
 
 
612 aa  101  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
631 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  24.76 
 
 
611 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  29.45 
 
 
525 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  27.03 
 
 
520 aa  98.2  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  25.45 
 
 
514 aa  94  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
666 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  27.98 
 
 
519 aa  90.1  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  28.2 
 
 
541 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  28.31 
 
 
556 aa  87.4  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.31 
 
 
556 aa  87.4  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  27.01 
 
 
516 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
586 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
554 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
564 aa  82.4  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.54 
 
 
534 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  26.43 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  23.4 
 
 
512 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  27.45 
 
 
596 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
514 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  26.87 
 
 
604 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  24.7 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  26.49 
 
 
563 aa  77  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  28.78 
 
 
563 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.78 
 
 
563 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  25.35 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  25.07 
 
 
601 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  26.46 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  27.33 
 
 
575 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  24.65 
 
 
601 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.85 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.85 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.06 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  25.96 
 
 
606 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  24.27 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  29.17 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  23.42 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  25.82 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.79 
 
 
479 aa  68.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  23.64 
 
 
578 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.54 
 
 
568 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  23.68 
 
 
510 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.54 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.54 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.54 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.54 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.54 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.54 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  23.61 
 
 
537 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
603 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
622 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
622 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.46 
 
 
601 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
556 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.72 
 
 
555 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.48 
 
 
613 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  26.95 
 
 
599 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
558 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.9 
 
 
552 aa  64.7  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  25.33 
 
 
323 aa  64.7  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  23.88 
 
 
561 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0586  hypothetical protein  28.4 
 
 
613 aa  63.9  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 
558 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
558 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 
558 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
476 aa  63.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.23 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
557 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  22.81 
 
 
565 aa  62  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  23.32 
 
 
556 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
558 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>