176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2076 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  91.03 
 
 		 584 aa  1013    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  74.87 
 
 		 581 aa  816    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  73.84 
 
 		 580 aa  851    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  76.42 
 
 		 581 aa  857    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  74.7 
 
 		 580 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 580 aa  1149    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3917  glycosyl transferase family protein 39  78.28 
 
 		 580 aa  874    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4551  glycosyl transferase family protein  45.96 
 
 		 577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4686  glycosyl transferase family 39  46.03 
 
 		 598 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  43.72 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4542  glycosyl transferase family 39  44.48 
 
 		 602 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0207348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5864  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 		 579 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0380825  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2164  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 		 573 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4173  glycosyl transferase family protein  53.48 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  37.73 
 
 		 552 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0012  glycosyl transferase family protein  38.4 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 		 570 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 568 aa  282  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1482  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 547 aa  269  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 		 637 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  28.7 
 
 		 528 aa  114  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  28.69 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  29.8 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  30.51 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  24.74 
 
 		 611 aa  103  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  28.65 
 
 		 605 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 553 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 631 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  24.64 
 
 		 612 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  25.61 
 
 		 612 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 666 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  25.37 
 
 		 520 aa  95.5  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  24.93 
 
 		 514 aa  95.1  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  28.17 
 
 		 519 aa  90.5  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  26.05 
 
 		 516 aa  87  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 554 aa  87  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.18 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  27.18 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.97 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.44 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  25.28 
 
 		 601 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  25.49 
 
 		 601 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  25.35 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  25.46 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.59 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  24.58 
 
 		 609 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.11 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  26.1 
 
 		 606 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.11 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.11 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.81 
 
 		 563 aa  77.4  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  28.81 
 
 		 563 aa  77.4  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  27.05 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  21.6 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.04 
 
 		 601 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  25.39 
 
 		 622 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  25.39 
 
 		 622 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  23.42 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.27 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 573 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  25.82 
 
 		 575 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  24.85 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  24.18 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  25.82 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  23.58 
 
 		 323 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.16 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  24.4 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.84 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.84 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.57 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  28.33 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  25.6 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  24.05 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.24 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  23 
 
 		 578 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.3 
 
 		 568 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  22.55 
 
 		 565 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.3 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.99 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.3 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.3 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.3 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.3 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.11 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 603 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.59 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0648  family 39 glycosyl transferase  24.06 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  25.51 
 
 		 580 aa  60.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  26.89 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6222  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>