66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3773 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3773  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase (lipid A modification)  100 
 
 
524 aa  1048    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17002  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6418  glycosyl transferase family 39  33.27 
 
 
537 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0742779  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0521  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
576 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.309275  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0231  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.14 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0407  glycosyl transferase family 39  24.14 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0124789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0564  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  22.44 
 
 
671 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1156  hypothetical protein  24.63 
 
 
450 aa  62.4  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  31.97 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  47.69 
 
 
580 aa  54.3  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  24.14 
 
 
537 aa  53.9  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0114  hypothetical protein  38.89 
 
 
587 aa  53.9  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.112922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04058  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase  26.7 
 
 
573 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 
534 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
585 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  38.67 
 
 
600 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  20.56 
 
 
527 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0282  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 
582 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0629741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4085  glycosyl transferase family protein  20.41 
 
 
574 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3882  glycosyl transferase family protein  20.41 
 
 
574 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
666 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3975  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 
574 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4690  hypothetical protein  42.59 
 
 
574 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  28.1 
 
 
536 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  21.57 
 
 
622 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  23.42 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
574 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4270  glycosyl transferase family 39  44.23 
 
 
574 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4465  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
574 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  21.57 
 
 
622 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.83 
 
 
556 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  34.55 
 
 
605 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3121  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
539 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
477 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  41.38 
 
 
569 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.71 
 
 
555 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.89 
 
 
556 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.66 
 
 
554 aa  47  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.66 
 
 
554 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.66 
 
 
554 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
564 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  32.08 
 
 
606 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  44 
 
 
636 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.19 
 
 
553 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4820  glycosyl transferase family 39  26.03 
 
 
528 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  44.68 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  44.68 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.63 
 
 
550 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1491  hypothetical protein  38.46 
 
 
523 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  44.68 
 
 
635 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
557 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  44.68 
 
 
635 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  44.68 
 
 
563 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  44.68 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  44.68 
 
 
605 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1926  hypothetical protein  47.62 
 
 
565 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1862  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 
565 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  22.86 
 
 
323 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.79 
 
 
550 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  25.87 
 
 
561 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.22 
 
 
575 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3109  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  20.73 
 
 
665 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00576177 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  25.58 
 
 
466 aa  44.3  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14251  glycosyltransferase  39.02 
 
 
533 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
509 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.63 
 
 
477 aa  43.5  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3582  glycosyl transferase family 39  27.44 
 
 
573 aa  43.5  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>