88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1034 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  68.4 
 
 
645 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  61.73 
 
 
668 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  61.22 
 
 
648 aa  719    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1250    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  68.46 
 
 
630 aa  804    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  68.56 
 
 
630 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  68.55 
 
 
645 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  73.42 
 
 
631 aa  772    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  91.57 
 
 
605 aa  1061    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  91.19 
 
 
635 aa  1109    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  68.46 
 
 
630 aa  804    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  91.19 
 
 
635 aa  1109    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  67.45 
 
 
599 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  91.57 
 
 
605 aa  1062    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  91.57 
 
 
605 aa  1061    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  93.25 
 
 
563 aa  1015    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  91.57 
 
 
605 aa  1062    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  68.46 
 
 
630 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  32.26 
 
 
660 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  31.53 
 
 
674 aa  251  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  33.01 
 
 
674 aa  246  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  35.03 
 
 
569 aa  244  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
558 aa  193  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  31.48 
 
 
552 aa  134  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  26.23 
 
 
600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  25.59 
 
 
598 aa  122  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  26.43 
 
 
585 aa  114  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  25.51 
 
 
596 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  26.79 
 
 
593 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  25.34 
 
 
596 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  26.72 
 
 
601 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  26.42 
 
 
613 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  24.96 
 
 
582 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  26.05 
 
 
605 aa  97.8  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  24.78 
 
 
605 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  25 
 
 
572 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  24.78 
 
 
582 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  24.48 
 
 
582 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  24.48 
 
 
582 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  24.48 
 
 
582 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  24.48 
 
 
582 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  26.32 
 
 
610 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  26.18 
 
 
610 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  26.18 
 
 
610 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  26.18 
 
 
585 aa  91.3  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
604 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  36.14 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  25.04 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  24.87 
 
 
585 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  25.21 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  36.42 
 
 
519 aa  62  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.74 
 
 
554 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.74 
 
 
554 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.74 
 
 
554 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2634  putative inner membrane transmembrane protein  29.8 
 
 
581 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123636  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.52 
 
 
569 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  28.02 
 
 
561 aa  53.9  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.93 
 
 
555 aa  53.9  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.05 
 
 
550 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  26.05 
 
 
550 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  26.05 
 
 
550 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.15 
 
 
550 aa  52  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.05 
 
 
550 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  27.62 
 
 
541 aa  51.6  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.05 
 
 
550 aa  50.8  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.28 
 
 
550 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.67 
 
 
550 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.8 
 
 
550 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3689  glycosyl transferase family 39  35.14 
 
 
524 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.32 
 
 
556 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  30.72 
 
 
616 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.23 
 
 
556 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  27.23 
 
 
575 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.57 
 
 
546 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
493 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  29.69 
 
 
587 aa  47.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  33.53 
 
 
532 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  41.18 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
585 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1792  hypothetical protein  22.69 
 
 
564 aa  45.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.018276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.65 
 
 
549 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3773  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase (lipid A modification)  53.12 
 
 
524 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17002  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2808  hypothetical protein  26.23 
 
 
537 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
553 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  41.79 
 
 
540 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  39.13 
 
 
510 aa  43.9  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
550 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
564 aa  43.9  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>