145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2381 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2381  transmembrane protein  100 
 
 		 569 aa  1119    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000535308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2292  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00662139  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4455  hypothetical protein  37.18 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3242  hypothetical protein  36.63 
 
 		 668 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2033  hypothetical protein  36.8 
 
 		 648 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.591759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1034  hypothetical protein  35.92 
 
 		 636 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1861  hypothetical protein  35.63 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.790877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1407  hypothetical protein  35.83 
 
 		 635 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.380672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1101  hypothetical protein  35.83 
 
 		 635 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0384  hypothetical protein  35.63 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.727782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0765  hypothetical protein  35.63 
 
 		 563 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1260  hypothetical protein  35.45 
 
 		 605 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1267  hypothetical protein  35.45 
 
 		 605 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.514254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2314  glycosyltransferase  35.54 
 
 		 645 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2192  glycosyltransferase  35.33 
 
 		 645 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.839356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2299  glycosyltransferase  33.45 
 
 		 630 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.813024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1664  glycosyltransferase  33.22 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2276  glycosyltransferase  33.22 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0071  hypothetical protein  32.31 
 
 		 660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5603  glycosyltransferase  34.74 
 
 		 630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3678  putative transmembrane protein  32.25 
 
 		 674 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1002  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 631 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.983807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3355  hypothetical protein  31.43 
 
 		 674 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1116  inner membrane transmembrane protein  28.52 
 
 		 596 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494519  normal  0.220996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1024  putative inner membrane transmembrane protein  28.87 
 
 		 596 aa  170  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.18489  normal  0.362431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1996  hypothetical protein  30.78 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0461641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1181  inner membrane transmembrane protein  27.78 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000439298  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2138  hypothetical protein  27.59 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23521  normal  0.937592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5135  glycosyltransferase  28.11 
 
 		 610 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.917614  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0041  hypothetical protein  32.83 
 
 		 519 aa  160  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1439  glycosyl transferase family protein  28.55 
 
 		 604 aa  159  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  hitchhiker  0.00674468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3000  hypothetical protein  31.37 
 
 		 540 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0521457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6245  glycosyltransferase  28.11 
 
 		 610 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1834  glycosyltransferase  28.11 
 
 		 610 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.355529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1745  glycosyltransferase  27.99 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1858  glycosyltransferase  28.08 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483257  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2121  inner membrane transmembrane protein  27.99 
 
 		 593 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0363283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2382  hypothetical protein  27.61 
 
 		 605 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0946  putative inner membrane protein  28.72 
 
 		 585 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0701589  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1772  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2216  hypothetical protein  27.9 
 
 		 582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2254  hypothetical protein  27.9 
 
 		 582 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0437004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1819  putative inner membrane protein  27.15 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.041941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1370  hypothetical protein  27.65 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2212  hypothetical protein  27.41 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1861  hypothetical protein  27.65 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0036  hypothetical protein  27.65 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224896  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1132  hypothetical protein  27.65 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2368  putative inner membrane protein  26.52 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70062  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1310  putative inner membrane transmembrane protein  27.31 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0636  putative inner membrane transmembrane protein  27.03 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  27.08 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.3 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  28.27 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  28.96 
 
 		 537 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  27.7 
 
 		 553 aa  72  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.42 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  25.97 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  28.94 
 
 		 575 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.36 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.6 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.46 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1280  hypothetical protein  29.23 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.12 
 
 		 568 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.36 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.36 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.36 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.36 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.36 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.72 
 
 		 549 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  25.88 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  25.71 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.24 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.95 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  25.56 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1494  putative inner membrane transmembrane protein  23.82 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2364  putative inner membrane transmembrane protein  23.78 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.02 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.98 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.98 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.98 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4910  putative inner membrane transmembrane protein  24.56 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2260  hypothetical protein  22.28 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.991842 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  27.88 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  27.88 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5588  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.7 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.21 
 
 		 550 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18330  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.66 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0521799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0012  putative inner membrane transmembrane protein  26 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2198  hypothetical protein  24.16 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0401619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1589  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.66 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4325  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 574 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>