199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_63700  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672224  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5537  hypothetical protein  92.26 
 
 
478 aa  688    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
476 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 
515 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  40.23 
 
 
468 aa  318  9e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  44.52 
 
 
464 aa  309  8e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0033  sugar transferase, putative  40.97 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0047  glycosyl transferase family protein  40.97 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.243952  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0050  glycosyl transferase family protein  40.97 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.127538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0047  glycosyl transferase family protein  40.97 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247457  hitchhiker  0.000148849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  40.49 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  40.17 
 
 
493 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  41.4 
 
 
479 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  43.94 
 
 
478 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  43.94 
 
 
477 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4250  glycosyl transferase family protein  42.83 
 
 
463 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00142595  unclonable  0.0000000186135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  39.79 
 
 
493 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  35.89 
 
 
575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
553 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  30.62 
 
 
553 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
584 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  31.48 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  31.45 
 
 
541 aa  126  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  30.9 
 
 
561 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1524  glycosyl transferase family 39  29.3 
 
 
540 aa  124  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  29.62 
 
 
575 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
557 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
564 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  29.03 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
586 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
557 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.21 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  30.21 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  30.21 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.38 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.21 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.21 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.7 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  29.19 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.21 
 
 
550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.2 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.21 
 
 
550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5573  glycosyl transferase family 39  32.52 
 
 
537 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0245521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
573 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  28.12 
 
 
556 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  28.31 
 
 
559 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.03 
 
 
552 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  28.36 
 
 
535 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  28.36 
 
 
535 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  27.2 
 
 
612 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  29.2 
 
 
537 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  25.96 
 
 
601 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.55 
 
 
555 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.12 
 
 
601 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.09 
 
 
550 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  27.7 
 
 
605 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  25.76 
 
 
606 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  27.46 
 
 
622 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  27.46 
 
 
622 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.49 
 
 
576 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32 
 
 
548 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
534 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.49 
 
 
576 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.49 
 
 
576 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.49 
 
 
576 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.95 
 
 
553 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.56 
 
 
569 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.49 
 
 
568 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32 
 
 
548 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32 
 
 
548 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  26.42 
 
 
612 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  29.49 
 
 
568 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32 
 
 
548 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.91 
 
 
556 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.72 
 
 
554 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  26.21 
 
 
601 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.72 
 
 
554 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.72 
 
 
554 aa  103  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  30.6 
 
 
556 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  31.25 
 
 
527 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03137  hypothetical protein  31.09 
 
 
551 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445477  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  29.9 
 
 
551 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1324  hypothetical protein  28.12 
 
 
556 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.71 
 
 
548 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
666 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  29.06 
 
 
578 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0471  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  30.71 
 
 
583 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.95 
 
 
601 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
631 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  27.27 
 
 
611 aa  97.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  29.1 
 
 
515 aa  97.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  26.45 
 
 
609 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  30.4 
 
 
556 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
600 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2190  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
541 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314824  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  28.33 
 
 
585 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
558 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>