22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1084 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0771  glycosyltransferase  69.11 
 
 		 503 aa  697    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1084  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 504 aa  1016    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.321902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  25.8 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0564  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase-like glycosyltransferase of PMT family  24.62 
 
 		 671 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  28.57 
 
 		 536 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0521  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 576 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.309275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0648  family 39 glycosyl transferase  34.65 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  23.39 
 
 		 528 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  27.5 
 
 		 527 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2697  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 493 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0933848  normal  0.158147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1297  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 515 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  23.34 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  24.32 
 
 		 596 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0731  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2836  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  30.82 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.72 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5109  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3121  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 539 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.25 
 
 		 550 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>