65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4565 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
559 aa  1102    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  58.96 
 
 
511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  55.85 
 
 
523 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  52.53 
 
 
493 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  52.53 
 
 
493 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  52.53 
 
 
493 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  53.74 
 
 
522 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  48.5 
 
 
516 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  49.17 
 
 
525 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  50.48 
 
 
528 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  46.89 
 
 
534 aa  412  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  43.98 
 
 
507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  36.74 
 
 
553 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 
528 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  40.12 
 
 
508 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  38.03 
 
 
547 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
534 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  38.52 
 
 
539 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
567 aa  290  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
586 aa  289  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  36.33 
 
 
520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  37.45 
 
 
531 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
569 aa  272  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  33.33 
 
 
573 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 
560 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  37.52 
 
 
539 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
541 aa  267  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  33.71 
 
 
638 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.33 
 
 
538 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  35.23 
 
 
592 aa  251  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  35.26 
 
 
544 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  34.59 
 
 
584 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  32.37 
 
 
572 aa  238  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  38.88 
 
 
563 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.24 
 
 
585 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  38.01 
 
 
537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  36.93 
 
 
555 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  33.27 
 
 
541 aa  219  7.999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  28.41 
 
 
441 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  24.06 
 
 
658 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 
493 aa  97.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  22.81 
 
 
492 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 
487 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  24.94 
 
 
469 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  24.52 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.93 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  23.87 
 
 
566 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 
968 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  24.49 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  23.31 
 
 
745 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  25.62 
 
 
918 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  27.55 
 
 
444 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05105  Dolichyl-phosphate-mannose:protein mannosyltransferasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WN5]  21.21 
 
 
740 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00465625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  21.91 
 
 
466 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
439 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
372 aa  51.2  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2751  glycosyl transferase family 39  28.03 
 
 
485 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72313  predicted protein  24 
 
 
758 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502969  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  20.25 
 
 
767 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0362  glycosyl transferase family 39  30.2 
 
 
475 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 
918 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
585 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
387 aa  44.3  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01930  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  24.22 
 
 
807 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>