156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2751 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2751  glycosyl transferase family 39  100 
 
 
485 aa  993    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2518  glycosyl transferase family 39  27.25 
 
 
530 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3588  glycosyl transferase family 39  27.25 
 
 
530 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196881  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3477  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
564 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  27.84 
 
 
527 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  27.46 
 
 
563 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.46 
 
 
563 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0648  family 39 glycosyl transferase  27.91 
 
 
515 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  24.79 
 
 
512 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  26.87 
 
 
514 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  25.91 
 
 
575 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4820  glycosyl transferase family 39  27.25 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.57 
 
 
552 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3121  glycosyl transferase family 39  26.89 
 
 
577 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.85 
 
 
550 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  26.56 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  26.54 
 
 
528 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.09 
 
 
550 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  26.71 
 
 
541 aa  73.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  27.38 
 
 
519 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.62 
 
 
550 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  25.62 
 
 
550 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  25.62 
 
 
550 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.62 
 
 
550 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.62 
 
 
550 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.09 
 
 
550 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  25.67 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.78 
 
 
550 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1297  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
564 aa  68.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.17 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.91 
 
 
556 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  26.91 
 
 
556 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.52 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  29.73 
 
 
323 aa  67  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  25.64 
 
 
575 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.53 
 
 
553 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0672  hypothetical protein  26.6 
 
 
493 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  22.12 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2183  family 39 glycosyl transferase  25.44 
 
 
536 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  25.54 
 
 
553 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 
554 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
586 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 
514 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
476 aa  64.3  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0482  glycosyl transferase family 39  25.53 
 
 
554 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 
557 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  24.85 
 
 
520 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3121  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
539 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  24.21 
 
 
578 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  24.37 
 
 
611 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
599 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.73 
 
 
550 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  23.75 
 
 
515 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.62 
 
 
554 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.62 
 
 
554 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  22.53 
 
 
479 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0488  hypothetical protein  25.45 
 
 
549 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
553 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.62 
 
 
554 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
637 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  22.12 
 
 
563 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1321  glycosyl transferase family 39  25.12 
 
 
541 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
582 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  23.27 
 
 
585 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0689  hypothetical protein  25.51 
 
 
493 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  26.02 
 
 
525 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  24.92 
 
 
556 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  23.7 
 
 
565 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.48 
 
 
548 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.48 
 
 
548 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.48 
 
 
548 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  24.64 
 
 
515 aa  57  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  27.56 
 
 
537 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2541  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.21 
 
 
548 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.17594  normal  0.550042 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0282  glycosyl transferase family 39  27.4 
 
 
559 aa  56.2  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.59 
 
 
556 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2486  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.21 
 
 
548 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 
600 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  23.47 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.82 
 
 
549 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 
558 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.91 
 
 
601 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 
666 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00382  glycosyl transferase, family 39  21.97 
 
 
580 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0797  glycosyl transferase family 39  23.1 
 
 
423 aa  54.7  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000309537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1792  hypothetical protein  22.59 
 
 
564 aa  54.3  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.018276 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5966  glycosyltransferase  23.46 
 
 
535 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1749  glycosyl transferase family 39  23.46 
 
 
535 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2693  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.42 
 
 
550 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421151  normal  0.435819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
585 aa  53.5  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  25.41 
 
 
600 aa  53.5  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2758  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.45 
 
 
569 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1795  glycosyl transferase family protein  23.34 
 
 
558 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  24.32 
 
 
561 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2325  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
613 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0922  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.52 
 
 
546 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.248037 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0769  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
522 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.534204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>