66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2538 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
2596 aa  5177    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 
2651 aa  1178    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 
2492 aa  1125    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  34.91 
 
 
2679 aa  1212    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  28.03 
 
 
1391 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  26.39 
 
 
743 aa  195  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  25.77 
 
 
842 aa  163  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  31.11 
 
 
729 aa  144  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  24.44 
 
 
804 aa  134  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  25.07 
 
 
647 aa  125  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  25.13 
 
 
794 aa  123  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  25.99 
 
 
664 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  23.39 
 
 
848 aa  105  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  27.36 
 
 
939 aa  90.1  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  26.69 
 
 
783 aa  88.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  33.17 
 
 
928 aa  88.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  26.52 
 
 
672 aa  85.5  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  25.53 
 
 
697 aa  85.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  30.46 
 
 
695 aa  83.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  25 
 
 
658 aa  78.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  30.7 
 
 
667 aa  73.2  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
448 aa  58.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
217 aa  55.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.09 
 
 
795 aa  54.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.54 
 
 
626 aa  53.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
614 aa  53.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
614 aa  52.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 
384 aa  52  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 
626 aa  51.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.06 
 
 
725 aa  51.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 
614 aa  51.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 
614 aa  51.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 
614 aa  51.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
1486 aa  51.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
878 aa  50.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.43 
 
 
629 aa  50.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.08 
 
 
810 aa  50.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
562 aa  49.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
615 aa  49.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
587 aa  48.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
573 aa  49.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
436 aa  48.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
762 aa  48.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
681 aa  48.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.5 
 
 
887 aa  48.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
605 aa  48.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
808 aa  47.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
226 aa  47.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
243 aa  47.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
1737 aa  47.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 
576 aa  47  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0043  TPR domain-containing protein  26.76 
 
 
627 aa  47  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
827 aa  47  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.54 
 
 
620 aa  47  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
415 aa  47  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
450 aa  46.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
377 aa  46.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
362 aa  46.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.61 
 
 
816 aa  46.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.88 
 
 
626 aa  46.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 
639 aa  46.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
804 aa  46.2  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0272  hypothetical protein  34.57 
 
 
204 aa  46.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
718 aa  45.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.72 
 
 
681 aa  45.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
3172 aa  45.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>