21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0531 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  100 
 
 		 939 aa  1857    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  71.96 
 
 		 928 aa  1251    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  40.87 
 
 		 842 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  32.2 
 
 		 804 aa  248  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  33.27 
 
 		 743 aa  210  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 		 2651 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.52 
 
 		 2492 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  27.92 
 
 		 2679 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  29.81 
 
 		 794 aa  120  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  27.66 
 
 		 1391 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  26.04 
 
 		 848 aa  114  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  28.19 
 
 		 695 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  27.38 
 
 		 664 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 2596 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  30.21 
 
 		 658 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  25.78 
 
 		 647 aa  99  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  29.4 
 
 		 697 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  35.38 
 
 		 729 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  27.27 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  26.99 
 
 		 783 aa  84.7  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  28.95 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>