21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0660 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  71.85 
 
 		 939 aa  1197    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  100 
 
 		 928 aa  1845    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  42.03 
 
 		 842 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  30.71 
 
 		 804 aa  250  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  34.17 
 
 		 743 aa  212  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  28.9 
 
 		 664 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.73 
 
 		 2492 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  30.74 
 
 		 794 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  27.72 
 
 		 1391 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 		 2651 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  25.09 
 
 		 848 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  36.68 
 
 		 2679 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  28.63 
 
 		 647 aa  106  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  28.24 
 
 		 695 aa  104  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  29.54 
 
 		 658 aa  103  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 2596 aa  98.2  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  28.76 
 
 		 697 aa  91.3  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  26.58 
 
 		 783 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  32.23 
 
 		 729 aa  88.6  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  28.94 
 
 		 667 aa  68.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  29.78 
 
 		 672 aa  56.6  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>