21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2422 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  100 
 
 
667 aa  1294    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  49.85 
 
 
658 aa  569  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  47.28 
 
 
647 aa  549  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  44.13 
 
 
664 aa  502  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  42.1 
 
 
697 aa  411  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  37.15 
 
 
672 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  37.81 
 
 
695 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  26.67 
 
 
729 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  24.32 
 
 
743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.98 
 
 
2492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  26.23 
 
 
1391 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  23.15 
 
 
848 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  35.86 
 
 
794 aa  94.4  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  27.95 
 
 
928 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  29.64 
 
 
2679 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  28.1 
 
 
842 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
2596 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  28.68 
 
 
783 aa  71.2  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  28.95 
 
 
939 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
2651 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  23.65 
 
 
804 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>