21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0522 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  53.87 
 
 
658 aa  679    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  54.75 
 
 
647 aa  677    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  100 
 
 
664 aa  1332    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  43.04 
 
 
695 aa  515  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  45.59 
 
 
697 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  42.47 
 
 
672 aa  487  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  43.83 
 
 
667 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  27.53 
 
 
794 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  27.75 
 
 
743 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  26.7 
 
 
1391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  25.9 
 
 
848 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  27.59 
 
 
783 aa  142  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  32.66 
 
 
729 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 
2492 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  28.9 
 
 
928 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  30.29 
 
 
2679 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
2651 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  26.59 
 
 
939 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
2596 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  25.45 
 
 
842 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  26.15 
 
 
804 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>