21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1496 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  100 
 
 
672 aa  1344    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  42.66 
 
 
658 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  44.75 
 
 
647 aa  500  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  42.94 
 
 
664 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  35.91 
 
 
667 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  35.99 
 
 
695 aa  364  3e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  37.71 
 
 
697 aa  335  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  29.46 
 
 
743 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  27.58 
 
 
1391 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 
2492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  30.77 
 
 
729 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  25.21 
 
 
842 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  26.73 
 
 
928 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  25.38 
 
 
939 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  29.71 
 
 
2679 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
2651 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  28.91 
 
 
794 aa  85.1  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  26.37 
 
 
783 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  23.66 
 
 
804 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  26.73 
 
 
848 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
2596 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>