22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0504 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  100 
 
 
729 aa  1474    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
2651 aa  253  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  31.26 
 
 
664 aa  251  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 
2492 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  31.68 
 
 
695 aa  237  7e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  29.72 
 
 
672 aa  225  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  28.14 
 
 
743 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  30.25 
 
 
1391 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  29.27 
 
 
658 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
2596 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  29.57 
 
 
647 aa  213  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  24.37 
 
 
842 aa  194  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  25.5 
 
 
848 aa  191  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  26.92 
 
 
794 aa  191  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  27.96 
 
 
697 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  26.86 
 
 
783 aa  184  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  29.94 
 
 
928 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  27.01 
 
 
667 aa  165  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  26.11 
 
 
2679 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  27.33 
 
 
939 aa  143  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  25.26 
 
 
804 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 
650 aa  44.3  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>