21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2672 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  100 
 
 
697 aa  1389    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  45.61 
 
 
664 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  44.36 
 
 
647 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  43.96 
 
 
658 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  37.45 
 
 
695 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  41.82 
 
 
667 aa  405  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  36.48 
 
 
672 aa  362  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  28.53 
 
 
729 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  29.28 
 
 
794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  28.62 
 
 
743 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 
2492 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  27.21 
 
 
1391 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  27.23 
 
 
783 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  30.64 
 
 
2679 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
2651 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  28.54 
 
 
928 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  29.12 
 
 
939 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  25.23 
 
 
804 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  27.43 
 
 
848 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
2596 aa  64.7  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  26.35 
 
 
842 aa  57.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>