21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0722 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  100 
 
 
658 aa  1296    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  57.65 
 
 
647 aa  715    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  53.87 
 
 
664 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  49.85 
 
 
667 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  42.66 
 
 
672 aa  491  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  43.57 
 
 
695 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  45.26 
 
 
697 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  29.21 
 
 
729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  27.94 
 
 
743 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  29.39 
 
 
794 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 
2492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  25.67 
 
 
1391 aa  122  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  27.74 
 
 
783 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  29.36 
 
 
2679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  30.5 
 
 
928 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  30.31 
 
 
939 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
2651 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  26.08 
 
 
804 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  27.44 
 
 
842 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  26.55 
 
 
848 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
2596 aa  73.9  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>