21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2886 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2886  membrane protein-like protein  100 
 
 
848 aa  1744    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.690188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0945  membrane protein  27.07 
 
 
743 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2106  hypothetical protein  24.43 
 
 
842 aa  164  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0944  glycosyl transferase family 39  24.19 
 
 
1391 aa  155  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0522  hypothetical protein  25.6 
 
 
664 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0660  hypothetical protein  25.68 
 
 
928 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.506781  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 
2651 aa  127  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 
2492 aa  124  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  25.12 
 
 
2679 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0504  hypothetical protein  27.89 
 
 
729 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0531  uncharacterized membrane protein-like protein  32.43 
 
 
939 aa  109  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2874  hypothetical protein  27.37 
 
 
794 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.816639  normal  0.782461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 
2596 aa  91.3  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1600  hypothetical protein  29 
 
 
695 aa  89.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496393  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0722  hypothetical protein  26.55 
 
 
658 aa  86.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.257337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0691  hypothetical protein  31.63 
 
 
647 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.723375  normal  0.166458 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2786  hypothetical protein  25.64 
 
 
783 aa  84  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.520143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2537  hypothetical protein  25.87 
 
 
804 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1496  hypothetical protein  26.73 
 
 
672 aa  80.9  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.702166  normal  0.0590672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2422  hypothetical protein  25.21 
 
 
667 aa  77  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2672  hypothetical protein  27.43 
 
 
697 aa  75.5  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>