91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0272 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0272  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2422  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.153836  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0692  TPR repeat-containing protein  42.79 
 
 
238 aa  154  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1966  TPR repeat-containing protein  38.28 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 
415 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  31.73 
 
 
573 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.18 
 
 
626 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
718 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
3145 aa  48.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
968 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
620 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34.25 
 
 
620 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
636 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
639 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 
767 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 
274 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
274 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
612 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  24.78 
 
 
520 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  33.33 
 
 
433 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2538  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
2596 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  33.33 
 
 
428 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  25.44 
 
 
586 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
426 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 
1129 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
233 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
311 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  45.61 
 
 
827 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
635 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
1737 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
611 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
635 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3473  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0242658  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
637 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  35.82 
 
 
1221 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
409 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
589 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
301 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  27.36 
 
 
937 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
617 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 
410 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3167  hypothetical protein  28 
 
 
296 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.4 
 
 
733 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
413 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 
565 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  32 
 
 
566 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 
612 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.31 
 
 
1056 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2819  hypothetical protein  32.58 
 
 
471 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70664  hitchhiker  0.00000273831 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
502 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.25 
 
 
884 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
585 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  31.94 
 
 
992 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
643 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
287 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
1161 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.59 
 
 
1676 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
615 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
572 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.17 
 
 
280 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.87 
 
 
736 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.87 
 
 
795 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
808 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  24.7 
 
 
267 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  23.26 
 
 
574 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  29.6 
 
 
955 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
716 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1853  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
502 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00620569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
619 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
468 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 
471 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
824 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
612 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.85 
 
 
561 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
645 aa  41.6  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
326 aa  41.2  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
988 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  31.82 
 
 
566 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1601  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 
355 aa  41.2  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.799203  unclonable  3.52104e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
792 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4749  hypothetical protein  28.07 
 
 
136 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.495876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>