131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2819 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2819  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  939    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70664  hitchhiker  0.00000273831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2153  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.569131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.41 
 
 		 781 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1276 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.58 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.16 
 
 		 810 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 		 572 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.39 
 
 		 784 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 878 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.68 
 
 		 2240 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 363 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 632 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 265 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.74 
 
 		 681 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 3035 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  28.22 
 
 		 624 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  20.47 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2046  tetratricopeptide protein  26.24 
 
 		 315 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000249019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 		 629 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 271 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.09 
 
 		 572 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.06 
 
 		 385 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 2262 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 515 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 3560 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 4079 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 776 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  18.79 
 
 		 750 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.33 
 
 		 729 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 883 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  27.54 
 
 		 929 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.52 
 
 		 1694 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  19.62 
 
 		 1297 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 		 357 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 1737 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.12 
 
 		 1154 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.15 
 
 		 622 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.67 
 
 		 988 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  22.58 
 
 		 979 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 762 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.47 
 
 		 884 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  20.28 
 
 		 833 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 292 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.6 
 
 		 639 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 187 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 374 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.64 
 
 		 548 aa  47.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.62 
 
 		 707 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 732 aa  47  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1927  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 381 aa  47  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 415 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  22.76 
 
 		 561 aa  47  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  23.83 
 
 		 252 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 245 aa  46.6  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.47 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 583 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.29 
 
 		 832 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 686 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 804 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.45 
 
 		 865 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  25.13 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 808 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.16 
 
 		 557 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  27.88 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  27.74 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.15 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  30.84 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 		 635 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  26.09 
 
 		 797 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.12 
 
 		 746 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  25.93 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000458235  unclonable  0.0000309501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 818 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  19.91 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.76 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 683 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 931 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  32.98 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>